屏幕方面，iPhone SE的外观相比于iPhone 5s并没有明显的改变，材质上，iPhone SE也同样采用了高档铝合金材质，配备与iPhone 5s一致的4英寸1136×640像素的屏幕。
而屏幕方面，苹果iPhone5S配备了4英寸屏幕，分辨率为1136*640像素，ppi为326。机身尺寸方面，iPhone5S为123.8*58.6*7.6毫米，重量为112克，和之前的iPhone5基本保持一致。
系统方面，iPhone SE搭载了iOS 9.3版本的系统。相对于iOS 9.2版本，iOS 9.3也新增了不少新特性，包括新增屏幕显示的Night Shift夜间模式以及优化和丰富备忘录、健康App和CarPay的体验。而系统方面，iPhone5S搭载了全新的iOS7系统，运行效果也有不错的表现。
配置方面，iPhone SE同样采用了A9处理器和Apple Pay的支持，与iPhone 6s保持一致，提供16GB/64GB两种容量规格，处理器主频为1840MHz。
而硬件方面算是iPhone5S很大的升级点。它搭载了全新的64位A7处理器，该处理器拥有2个通用寄存器、超过10亿晶体管。iOS7可以完美兼容A7处理器。除了A7处理器之外，此次苹果iPhone5S中还加入了一个M7协处理器，协处理器主要是用来识别传感器指令，包括一些速度计、指南针、陀螺仪等等，同时第三方应用也可以很好的利用这个技术来优化。
摄像头方面，iPhone SE摄像头升级为后置1200万像素，相比iPhone 5S内置的后置800万像素摄像头，单个像素1.22微米，光圈f/2.2，支持Focus Pixels自动对焦，支持LivePhoto。摄像头规格提升还是十分明显的，拍照方面自然会有出色表现。
而摄像头方面，苹果iPhone5S采用800万像素背照式摄像头，单个像素尺寸为1.5微米，拥有F/2.2光圈。为了提升iPhone5S的夜拍能力，它还采用了双LED闪光灯。摄像头拥有蓝宝石水晶镜头表面以及5镜式镜头。
