进入游戏选完男女主（男为小智，女为小瑶），电脑里有一个学习装置，旁边有大蘑菇。
与妈妈对话完才知道现在的时间是我们参加完石英联盟。
现在去大木那里获得新的精灵，火球鼠，小锯鳄，菊草叶，接着大木会让我们去桔梗市找空木博士拿他的包裹（你快递就不能填自己的地址吗？一直都是要我们跑腿）
从真新镇出发，刚刚走出镇子，我们就遇到了劲敌Dio桑，开局就是双打。
路上有一个电击怪精灵蛋，还有技能机记得拿。
拿到包裹后出了PC中心就遇到了火箭队想抢我们的包裹，这时候君沙小姐来帮我们解围，我们回去PC中心回复一下状态，顺便介绍下两个机器。一个是看亲密度的，一个是看个体和努力值的。
很多房子里的冰箱都有汽水，我们直接拿了，不要客气，我的游戏，里面的东西都是我们，你家的也是我的。
回去将包裹给大木，大木就会交给我图鉴（此版本只有312只精灵，即关东和成都）
图鉴还会告诉我精灵的进化情况，拿到图鉴我们就去大木孙女家拿地图（什么时候大木有孙女了？）
到达桔梗市，道馆里面没人，我们就经过冰雪小径，门口有个女的拦路叫我们回去打道馆。
桔梗市飞行系道馆馆主阿速精灵：咕咕，比比鸟
难度不大，皮卡丘平推。
打败阿速，经过冰雪小径我们来到了桧皮镇，这里被火箭队占领了，去PC中心回复下状态我们就去上方的博物馆，打败看门的小喽啰，我们进入博物馆，发现空木也在，火箭队的小喽啰正在询问洛奇亚的情况，我们直接上前打败小喽啰，出了博物馆的大门，空木接着出来说博物馆很感谢我们的帮助，送了我们一只3D龙
接着就可以去打虫系道馆了。
阿笔的精灵：铁甲蛹，圆丝蛛，飞天螳螂
打败阿笔，往右走，研究员会给我们一个蛋，带上开孵，接着我们就又遇到了劲敌。
劲敌精灵：鬼斯，小磁怪，火焰鼠
往右走，路上道具记得拿。
向上我们来到互联洞，洞里很多火箭队，顺着路一直走就可以走出互联洞，向右来到淘金市，这时候道馆里面是没人的，我们向上走会遇到武藏小次郎喵喵的火箭队三人组
双打火箭队：果然翁，蜻蜻蜓，大舌头，卡蒂狗
打败后我们来到湖中小屋，坂木和几个火箭队成员正在对超梦进行研究。
对话完，坂木就拿着超梦打了过来
被剧情强杀之后我们回到淘金市往下走，会遇到君沙小姐，对话送给我们一双跑鞋，这时候就可以去打道馆了
小茜的精灵：皮皮，大舌头，大奶罐
打败小茜后往下走
向下来到圆朱市，先去道馆出发剧情，劲敌的较量
劲敌：鬼斯，超音蝠，小磁怪，火焰鼠
打完以后我们回去满金市左上角触发洛奇亚剧情
来到洞穴深处触发剧情
再次被70级的水君剧情杀，这时候空木过来帮忙了，给了我们一只雷公
打败后就可以去打园朱市的鬼系道馆了
小松的精灵：鬼斯，鬼斯通2只，耿鬼，
打败小松后，我们就可以从满金市往右走了，经过吉花市，这里左上角的屋子里对话得到闪光超音蝠，个体是6V
吉花市左边洞窟遇到火箭队小兵，打完剧情我们就去12号道路，一路穿行来到浅葱市
道馆门口会遇到劲敌，然后就去灯塔对话馆主
向下走经过水路来到湛蓝市，先去商店拿到秘药，然后就去打道馆馆主精灵：猴怪，火爆猴，快泳蛙
打败馆主阿四以后我们再回到吉花市，把秘药给阿蜜，接着就可以打道馆了
馆主精灵：小磁怪，三合一磁怪，大钢蛇
打败馆主后我们从左走接着向上，去卡吉市
刚到卡吉市就遇到了君沙，我们去医院触发剧情，然后去这里触发剧情，里面是火箭队的地下基地
打完火箭队接着就要打劲敌，打完劲敌就可以去打冰系道馆了
往右去烟墨市，我们现在去湛蓝市上面触发火箭队剧情
又遇到了火箭队
在最里面遇到了被坂木威胁的空木
坂木的精灵：铁甲超梦，暗黑洛奇亚
打败后空木会给我们一颗洛奇亚的蛋（女主会是凤凰）
然后去烟墨市拿最后一个徽章，去打四天王了
