在游戏刚开始进行的时候是不能进入地下的，当剧情发展到第2道馆的白岱市时，主角就可以从民居中的地下老爷爷那里获得底下的探险装备，获得后打开菜单就在重要物品里，接下来就可以进入地下世界了。
在房屋外的任意地点（洞穴外）使用该道具就可以进入地下世界，为了防止异常情况的发生在进入地下世界后是会要求自动保存进度的，在存档完成后才能进入。
第一次进去还会遇到第一个岩石道馆的馆主为你的来到表示欢迎！ 进入地下后这里的环境是个巨大的地下迷宫，从上屏可以看到迷宫的全貌——注意这是整个新奥地下世界从地面的不同地方近来的位置也会发生改变，而并不是地下的任意地方都可以到达。
部分类似于“死胡同”的区域只有在地面上的特定区域才能到达。
而无论玩家在地下移动多远，当返回地面的时候都会回到进入地下的位置。
所以不用担心在地下迷宫迷路。
一.地下世界的游戏菜单：1.陷阱：各类陷阱类道具及钻头。
2.玉：挖掘获得的玉，有个数上限：对单一玉可以选择埋或扔。
3.家具：可放置与秘密基地中。
4.宝物：挖掘获得的道具，有上限，对单一道具可选择放入地上背包或扔。
5.主角名字：地下世界的冒险记录。
6.地面：返回地面。
7.关闭菜单 二.底下世界的探宝和挖掘 地下迷宫有隐藏着丰富的宝藏等待着玩家去探索当然只在迷宫乱转是不会显示出来的，下面来看看探宝的步骤： 寻找宝物所在的地点：在底下点击下屏的任意地方，会出现一个圆形探测圈，这个圈可以显示出附近是否有宝物隐藏，如果有宝物隐藏，则会在圈附近一亮点来表示出来，探测圈消失后亮点也回消失，所以要记住亮点的位置,不过不用担心宝物回消失。
出现亮点所对应的宝物在你没有去调查前将一直存在。
上屏的迷宫地图界面会用光星显示出报务出现的地点，但有时间限制，需要及时去查看是否有宝物亮点。
注意：一般在地面上的亮点大都是“陷阱”如果是宝物只要移动到亮点旁边的地面上，面对亮点按A进行调查就可以获得，而如果是陷阱那么就需要相对应的方式来解救自己。
三。
挖掘墙壁中的宝物 当发现墙壁中的宝物是调查后将进入挖掘界面,此时要注意的是下屏上的文字提示信息，在文字中可以很明显的看到一个数字信息，该数字代表了隐藏在本屏幕中的可获得物品个数：随后就可以用大锤和小锤进行挖掘了——大锤可以开掘较大范围的地面，但造成的震动也比较大：小的相反：屏幕上的地面坚硬程度依次为：石头》黑色地面》土地》宝物，想得到宝物就要挖掘到最后一层！*挖掘的注意事项： 挖掘到的单个宝物必须全部显示出来才能在结束后获得： 挖掘画面耐久效果为20，使用大锤一次减1，使用小锤3次减1，达到0时崩溃： 当挖掘到坚硬岩石层时只能开掘出一块地面，同样消耗耐久： 当本屏幕所提示数量的物品全部挖掘出来后本次挖自动结束。
*挖掘可以获得的物品：各色的玉：根据玉的大小品质可在地下大叔处兑换道具。
化石：可返回地面的黑金市研究所进行复活，获得相应怪兽。
各色的碎片：可换取对应的进化石。
进化石：不用我说了吧。
其他道具：特殊的石头.石板.复活药等可带回地面后直接发挥效果的。
*关于玉的增殖 在挖掘中获得的各色的玉，这些玉根据颜色，大小有不同的分类及各自的品质，不过他们是不能被带回地面上卖钱的，只能在底下与固定地点出现的地下大叔兑换道具，作用类似与地下的货币。
一般刚挖掘出来的宝石品质根据其对应的数字来表示，一般刚挖掘出来的宝石的品质数值从1—24不等，可以通过站在同一位置想地面扔同一颜色的玉进行叠加，提升宝石的品质，以兑换到更好的商品。
注意这个数值并不是简单地相加，而是以第一快埋下的玉作为基础数值，然后不同数值的玉埋下后增加对应级别的数值：品质1~4—增加1 品质5~9增加2 以此类推下去 最大5。
*地下大叔 出现在迷宫中的任务，类似于商店老板，可以从他那里换取各种陷阱以及开掘秘密基地所需要的道具。
大叔处有不少好的道具可以获得，但是一般需要品质较高的玉来换取。
以下是他固定会出现的几个地点：1.从主角家门口下到地下，向下走第一个路口右拐。
2.从白岱市口袋中心门口下地，向下穿过小路。
3.从冠凤镇口袋中心门口进入地下，向左下方走，向右上方走穿过小路也有一位。
4.从金岬市口袋中心门口下到地下，向下走。
*秘密基地 本作中的秘密基地是建造在地下的，不仅因为地下有足够的空间来发挥，同样也是因为为了对应WIFI盗旗模式做出的准备。
本作中是用一种叫做 挖掘转头 的道具来进行开辟的。
该道具可以在大叔处兑换得到，面对地底的任意墙壁使用该道具，就可以在墙上挖掘出一个洞，进入后就可以开始建造自己的基地了。
刚开掘的房间会有很多巨大的岩石块 ，以后还可以不断地扩充。
二 秘密基地的盗旗模式 当进入地下时，玩家可以注意到下屏的右上角出现WIFI通信标志，因此地下世界是可以与其他玩家进行游戏的，不仅可以一起挖宝，更加吸引人的就是互相竞争的盗旗模式！*从其他人的秘密基地盗取旗帜 既然是从别人的基地盗旗，自然首先就是先找到对方的秘密基地了，进行WIFI通信时双方的秘密基地都会显示在屏幕上，因此寻找到对方秘密基地的入口是第一步。
寻找到入口后，在外面等待对方出行的时刻，伺机进入对方的秘密基地，从对方的电脑旁拿起旗帜，接下来只要成功回到自己的秘密基地就算盗旗成功。
虽然步骤看起来十分简单，但操作起来绝非易事，返回时除了小心对手杀回来围追堵截，更要注意从天而降的各种陷阱，所以能够成功盗旗也是技术的体现。
盗旗成功后会被记录在电脑里，可以通过盗旗胜利来扩充自己的秘密基地。
*设置陷阱 陷阱是在低地下世界非常重要的道具之一，除了在点击画面时产生探测光圈时地面的闪光点是陷阱可以拣起之外，还可以从大叔处用玉兑换获得。
大体来说陷阱分为三大类：方向陷阱：一般这样的陷阱的后面会有一个小箭头指示方向一直移动直到碰到障碍物，无副作用。
触摸屏消除类：这样的陷阱一旦踩上就会被暂时困住，需要点击触摸屏消除障碍后方可继续移动。
麦克风类：同触摸屏类一样会被捆住需要利用DS麦克风功能来消除障碍物。
