某人被囚禁在高层。
剧情是：最近，米花街出现了上百架印有奇怪图案的纸飞机，连米花小学的少年侦探团也开始关注起这个事情。而柯南则不以为然。
兰和园子按照惯例，每月一次来到新一家打扫卫生，温暖而干净的房间，让兰以为是新一回来了。四处寻找后，却在那里遇见了寄居在新一家的冲矢昴。兰将他误认为是小偷，不由分说地飞起便是一脚，冲矢被重重地踢倒在地。此时，柯南及时地打来了电话，解开了兰的误解。
之后，冲矢昴根据园子的一些动作和反应，推理出了兰和园子吃午饭的场所。佩服至极的园子决定让新一和冲矢昴一决高下，而对决的题目就是那些画着奇怪图案的纸飞机。
柯南和冲矢分别看了落在园子家庭院里的纸飞机后，得出相同的结论说：“这是SOS”，并要求看印有其他图案的纸飞机...
冲矢昴告诉兰和园子，在纸飞机上画的图案是摩斯电码。三个圆点、三条短线、三个圆点，表示的意思是：SOS。在与冲矢昴的交谈中，兰因为心中的莫名不安，而不自觉地向冲矢昴隐瞒了新一是高中生侦探的事情。
兰将第二天出现的纸飞机拍了照片，通过手机邮件传给了新一的同时，将纸飞机拿给冲矢昴看。冲矢昴和柯南得出了同一个结论：求救者被囚禁在手机服务区外。
两人在分别看了电视台报道的“造船会社社长被绑架的事件”和第三天的纸飞机图案后，柯不约而同地开始折起了纸飞机...
根据柯南和冲矢的推理，三天以来的纸飞机上的图案所要表达的意思分别是：SOS、在手机服务区外、米花街，得出“纸飞机怪人被囚禁在米花街的某处高层建筑中，情况相当危险”。
柯南（新一）通过手机指示兰去可疑高层建筑物对面的饭店乘坐观光电梯，并且用望远镜观察对面建筑物的哪个阳台上有零散的纸飞机。兰果然发现了许多纸飞机，随后直接跑去对面高层建筑物的那个房间救人，而且按照柯南（新一）的指示，给代田总经理做了紧急抢救，使之转危为安。
