1、一、女尸之谜
东陵盗案发生后的1928年8月，清逊帝溥仪派载泽、耆龄等人到东陵进行善后处理。他们在清理裕陵地宫时，发现了一具完整的女尸。
耆龄在《东陵日记》中写道：午后得报，于两棺之间寻得女体一，身着明黄龙袍，又于侧近拾得绣凤黄靴二。面目可辨，年约六十余，齿存一二，耳环尚在，不知是后是妃。
据宗室遗臣判断，此具女尸是嘉庆帝的生母孝仪皇后，卒年49岁。裕陵地宫中的六位墓主人，其他五人都成了堆白骨而唯独她的遗体完整，没有腐烂，面目如生，至今无法解释。
二、棺椁顶门之谜
1928年孙殿英匪军在盜裕陵地宫时，曾顺利地打开了前三道石门，但第四道石门却无论如何也不能打开，便气急败坏地用炸药炸开了石门。匪徒们进了地宫金券后发现原来有一具巨大的棺木顶住了第四道石门。
后来，从这具棺木中找到了乾隆帝的头颅骨，才知道顶门的是乾隆帝的棺椁。溥仪派到东陵善后的大臣重验裕陵遗骨时，将乾隆帝的内棺重新安放在正面棺床的正中之位，并将一帝一后三妃的遗骨殓入棺内。可是到了1975年，清东陵文物保管所开启地宫时，又是乾隆帝的内棺顶住了石门。
裕陵地宫每具棺椁的四角，各有一块重达数百斤的龙山石将棺椁牢牢地固定在棺床上。龙山石底部伸出的四棱形榫，根部细下端粗。榫插入石制棺床上的长方形眼中，向旁边相通的方眼推，由于这个方眼口小下大，石榫插入后再也休想拔出来。龙山石上凿有纵向和横向的沟槽，椁的竖向边棱被卡在纵向槽内，椁底部伸出的横向边棱被龙山石的横向槽卡压，使棺椁不能移动。然而，孙殿英匪兵在进人裕陵地宫时，竟发现乾隆帝的棺椁不在棺床上而是顶住了第四道石门。既然棺椁的四角都被龙山石牢固地固定在了棺床上了，怎么脱开棺床顶住了石门？令人百思不解。
三、石柱之谜
现在裕陵地宫的前三道石门，每道都用四根巨大的四棱形石柱支顶着，共有石柱12根。12根石柱中第一道石门里侧的两根和第二、第三道石门的八根，都是1989年12月15日由清东陵文物管理处古建队支顶的。而第一道石门外侧的两根石柱，支顶日期却是一个未知数。
四、龙山石之谜
为了防止棺椁入葬地宫后，因受到外界力量而发生移动，特在棺椁的四角各安设了一块龙山石。令人意想不到的是孝贤皇后梓宫东南角的龙山石有一道斜着的裂缝，裂缝和铁锔处抹上了石灰和石粉做假。孝贤皇后是在乾隆十七年入葬地宫的。这个龙山石是怎么坏的？又是在何时安的铁锔子？
五、渗水之谜
裕陵建成于乾隆十七年，建成的当年地宫里就出现了渗水。乾隆帝曾命大臣三和等加紧维修整治，费了很大劲才解决了问题。嘉庆四年，乾隆帝正式入葬。在这前后47年的时间里，地宫里始终没有再出现渗水现象。在1928年重殓裕陵遗骨时，地宫里竟有两米多深的积水。自1978年裕陵地宫开放至今，每到盛夏阴雨连绵的季节，必须天天抽水。裕陵地宫为什么又再次出现渗水？现在谁也说不清。
六、金券歪斜之谜
裕陵地宫有九道券，最后是金券，乾隆帝的棺椁就位于金券正中。如果我们站在第一道石门门口向里看，会发现乾隆棺椁是歪斜的，与前七券的方向明显不一致。为什么会出现这种现象？有人解释说，前七券的方向是风水线，金券的方向是子午线。测量表明，地宫的前七券还真是风水线，与地面建筑的中轴线方向是一致的。但金券方向却与子午线即正南正北方向偏离十五度。
