上古年间，黄帝打败蚩尤之后，无法杀死蚩尤，只得把它封印，蚩尤的身体化为双角和魔心。
一只角被黄帝封在神荼山下面，并建立了神荼派，让他们镇压封印，消灭蚩尤余党。
魔心被黄帝封印在天上的星辰里面。
还有一只角不知所踪。
然后发生了一些天象变化，揭示蚩尤要复活了。皇埔非常担心，这时候出现一个叫乌桓的人，对上古年间的时候知道的非常清楚。自称是炎帝后裔，要来帮助皇埔。
过了几年乌桓带了个小女孩来，说这个小女孩的父母都被妖怪杀了。皇埔立刻发现这个小女孩身上有蚩尤气息。了解到她可能是蚩尤的第二只角转世。决定收她为徒，将她引入正道。
后来这个小女孩也就是主角长大之后，在乌桓的安排下，和蚩尤的老部下，刑天，共工，夸父等交手。夺得了他们的内丹，交给乌桓先生，用来封印蚩尤。
但是在战斗中她也感受到疑惑，刑天夸父共工并不想和她战斗。在重伤共工之后，共工打开了琉璃幻境，让她去发掘真正的答案。
在幻境中九黎打败了自己的心魔和梦魇，了解到其实杀自己母亲的人是乌桓。于是杀回神荼要报仇。
在重创神荼之后，九黎又大战师父皇埔，并重伤他。九黎感受到师父手下留情了，于是质问他为什么要杀自己的家人。
皇埔表示不知情，这时候乌桓现身，原来他就是蚩尤手下的饕餮。要复活蚩尤需要蚩尤双角，并用四大手下的力量把双角送到魔心那里。
由于其他3人表示事情已经过去，不想再战。于是饕餮用计让力量克制他们的蚩尤角化身九黎去斩杀他们取得他们的内丹。由于九黎的力量也能克制饕餮，所以他不敢在神荼山动九黎，杀死师父夺得另一只角之后匆匆逃走。
九黎追饕餮到它老巢，饕餮准备在这里用人海战术削弱九黎。但是最后仍然被九黎打败。于是饕餮献祭了自己，用4大手下的力量送了一只蚩尤角上去。虽然蚩尤复活后只有一半力量，但是没有黄帝的世界是挡不住它的。
接下来就是九黎也杀上天，蚩尤角对蚩尤角，最后终于打败了蚩尤，将他再度封印。
