清代皇族分布八旗之内。只有皇帝本人才固定为镶黄旗。
顺治亲政后，最终确定两黄旗及夺自多尔衮嗣子多尔博的正白旗为上三旗（可笑啊，乾隆43年恢复多尔衮的亲王位，找来多尔博子孙受爵，却不将正白旗还給人家），上三旗事务及士兵由皇帝亲将，无旗主，负责京畿地区防务。下五旗分布各重要城市，从事警备及监督绿营的任务。
事实上，努尔哈赤后期到皇太极掌权前，多尔衮兄弟掌握的两黄旗才是真正的两黄旗。因满族尚黄，所以皇太极将自己的两白旗强行与两黄旗对换旗色。就是说，皇太极之后两黄旗的主体部分其实是努尔哈赤后期的正白旗和正蓝旗。因后世皇帝都出自皇太极子孙，所以镶黄旗的政治地位得到了保持。
自康西掌权开始，旗主的政治地位逐步下降，不再有诸王贝勒议政的权力，清代正式从军事贵族合议制彻底转变为皇帝全权独裁制。尤其康西的成年儿子太多，上三旗的200多个牛禄无法安置，就乘机将诸子分到各旗任旗主、王、贝勒，以成惯例。这个行为当然会分去很多牛录，但原来的旗主王公实际已经反抗不了了。
就是说，除非某个皇子成为皇帝，否则他的旗属就被固定在皇父之前分配的某旗。
下面说为什么镶黄旗地位最高。
皇太极当政后趁机占有镶白旗，以儿子豪格作旗主(镶白旗旗主杜度之前已被努尔哈赤调到镶红旗)。之后，皇太极杀掉镶蓝旗主阿敏和正蓝旗主莽古尔泰，为完全吞并正蓝旗，将正蓝旗和自己的正黄旗（原正白旗）混编再一分为二，组成新的正黄和镶黄旗，并分出8个牛录給豪格。豪格此时有原镶白旗（对换旗色后的镶黄旗），加上八个牛录后改正蓝旗。所以皇太级时期的上三旗为两黄旗及豪格正蓝旗，合117牛录，为第一大势力，多尔衮三兄弟拥有有两白旗98牛录，为第二大势力。其余两红及镶蓝旗合96个牛录为吃瓜群众。
背景：
1、黑旗。黑旗是努尔哈赤家乡周围满族部落组成的第一旗。努尔哈赤势力扩大后再组黄旗，黑旗交由弟弟舒尔哈齐统帅。舒尔哈齐反叛被杀，黑旗一分为三：正红旗25牛录，旗主努尔哈赤次子代善，镶红旗26牛录，旗主代善长子岳托，镶蓝旗33个牛录，旗主舒尔哈齐第二子阿敏。
2、白旗。皇太极原正白旗来自于满族第三旗（白旗）。白旗是满族最大的哈达部组成，旗主是努尔哈赤长子褚英。褚英当时已明确定为努尔哈赤继承人，可想此旗实力最大。褚英被杀，白旗一分为三：正蓝旗21牛录（满牛录，下同），旗主努尔哈赤第五子莽古尔泰。正白旗18牛录，旗主是努尔哈赤世交董鄂和合理（董鄂氏本出自爱新觉罗氏，至努尔哈赤爷爷一代才正式分出，之后，正白旗由皇太极控制）。镶白旗15牛录，旗主是褚英长子杜度。
3、黄旗。努尔哈赤将自己所统的黄旗分为两旗，正黄旗（45牛录）和镶黄旗（20牛录），晚年将两黄旗大部分授予同母三个幼子（阿济格，多尔衮和多铎），每人15牛录，其余作为亲军，他曾有明确指示：阿济格是镶黄旗旗主，多铎是正黄旗旗主，自己死后亲军全给多铎，但另赐一旗给多尔衮。所以，阿济格，多尔衮和多铎三兄弟后来能在年长哥哥侄儿群伺情况下生存下来，最大倚仗就是这最初的两黄旗65牛录（当是绝对精锐的精锐）。
因此，皇太极组建的新镶黄旗大体出自白旗（皇太极正白旗及莽古尔泰正蓝旗）。
即是说，新镶黄旗主体是较早臣服努尔哈赤，也是力量最强大的哈达部。显然占有较高职务和较多资源，当然有极高的地位。
